现有农学院、植物保护学院、园艺园林学院、资源与环境学院、工程学院、水利与土木工程学院、动物科学技术学院、动物医学学院、生命科学学院、食品学院、经济管理学院、文理学院、艺术学院、公共管理与法学院、马克思主义学院、电气与信息学院、国际文化教育学院等17个学院。

1个 全国重点实验室

智慧农场技术与系统全国重点实验室

1个 国家级工程研究中心

寒地小浆果开发利用国家地方联合工程研究中心

2个 国家级工程技术研究中心

国家大豆工程技术研究中心

国家乳业工程技术研究中心

1个 教育部工程研究中心

北方寒区猪智能化繁育与养殖教育部工程研究中心

3个 教育部重点实验室

大豆生物学教育部重点实验室

乳品科学教育部重点实验室

寒地粮食作物种质创新与生理生态教育部重点实验室

1个 教育部省部共建协同创新中心

黑龙江省粮食产能提升省部共建协同创新中心

3个 农业农村部农业科学观测实验站

农业农村部动物疫病病原生物学东北科学观测实验站

农业农村部东北动物营养与饲料科学观测实验站

农业农村部东北地区作物栽培科学观测实验站

7个 农业农村部重点实验室

农业农村部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室

农业农村部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室

农业农村部鸡遗传育种重点实验室

农业农村部农业水资源高效利用重点实验室

农业农村部生猪养殖设施工程重点实验室

农业农村部高效播种收获装备重点实验室

农业农村部东北智慧农业技术重点实验室

2个 农业农村部区域试验站

黑龙江省哈尔滨市国家级农作物品种区域试验站

黑龙江省东北农业大学区域性品种测试站

4个 农业农村部科研基地

农业农村部北方马铃薯全程机械化科研基地

农业农村部大豆传统制品加工技术集成科研基地

农业农村部北方一季稻全程机械化科研基地

农业农村部干乳制品加工技术集成科研基地

1个 科技部创新人才培养基地

1个 高等学校科技成果转化和技术转移基地

1个 国家级大学科技园

1个国家“双一流”建设学科：畜牧学

3个国家重点学科：农业机械化工程、基础兽医学、动物营养与饲料科学

3个国家重点（培育）学科：蔬菜学、动物遗传育种与繁殖、临床兽医学

2个农业农村部重点学科：动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学

12个黑龙江省优势特色学科：畜牧学、农业工程、食品科学与工程、兽医学、农林经济管理、作物学、园艺学、农业资源与环境、生物学、农业人工智能、水利工程、植物保护

1个ESI前1‰学科领域：农业科学

8个ESI前1%学科领域：农业科学、植物学与动物学、生物学与生物化学、环境/生态学、工程学、药理学与毒理学、微生物学、化学

学校是全国首批具有博士、硕士学位授予权的高等学校之一，现有10个博士学位授权一级学科点，21个硕士学位授权一级学科点；2个博士专业学位授权类别，15个硕士专业学位授权类别；10个博士后科研流动站、2个博士后科研工作站；76个本科专业，国家级特色专业10个，国家级一流本科专业建设点24个、省级一流本科专业建设点43个，入选国家级综合改革试点专业1个，通过工程教育专业认证专业4个。

学校现有专任教师1 569人，其中教授356人、副教授567人，具有博士学位者1 065人、硕士学位者424人。现有各类国家级人才115人次，各类省级人才212人次，教育部创新团队2个，农业农村部第二批农业科研杰出人才及其创新团队4个，国家级教学团队2个，全国高校黄大年式教师团队3个，黑龙江省“头雁团队”5个，博士生导师354人。

学校现有全日制在校生32735人，其中本科生24781人、研究生7628人、外国留学生326人。