生物医学工程是理科、工科与医科等学科高度交叉的极具前景的朝阳专业。研究领域涵盖生物材料、生物医药、组织工程、生物医学信号处理方法、医学成像和图像处理等诸多方面。本专业通过运用自然科学和工程技术的原理和方法，致力于研究和解决生物学、医学领域的核心问题，为疾病的预防、诊断、治疗和康复等相关产业提供技术支撑，所带动的医疗器械和医药产业在国民经济中占有重要地位。生物医学工程系自2016年成立以来，经多年精心打造，已将生物医学工程建设成为福建省重点学科。设有生物医学工程本科专业、生物医学工程一级学科硕士点和生物与医药工程二级学科博士点，旨在培养能够在医疗器械、生物医药、医疗卫生检测、生物电子信息等相关行业从事科学研究、技术开发、仪器研制与维护、教育和管理等工作的复合型人才。本专业汇集一支高素质的专任教师团队，共计31人，师生比例高（2023级本科生62人）。其中，正高级（教授、研究员）教师9人，副高级教师11人，“闽江学者特聘教授”7人，省级以上高层次人才十余人。在科研方面，近5年来本系教师在Nature、Cell子刊等国际高水平学术期刊上发表论文150余篇；主持和参与了包括国家自然科学基金重点项目、国家重点研发计划、科技部公关项目等在内的国家和省部级项目50余项；获得国家发明专利超过50项。本专业的课程设置特色鲜明。（1）紧密结合一线科研教师的最新研究成果，以科研“反哺”教学，开设具有创新性的综合性和设计性实验课程，注重培养学生独立思考、分析和解决问题的能力。（2）推出线上线下混合虚拟仿真平台教学课程，利用AR和VR模拟技术，为学生提供身临其境的实践体验，学习精密手术或重大科学仪器的操作过程。（3）建设各级“一流课程”共5门；（4）开设多门实习实践课程，建立稳定的校外实践基地11个。鼓励本科学生加入科研团队，进行科研训练，直接参与甚至主导科研项目。近5年，学生参加本科生科研训练计划（SRTP）项目84项，其中包括省级和国家级项目19项，涉及纳米医学、生物医药、生物信息学、人工智能、生物医学材料等多个前沿领域。参加国家级和省级大学生双创项目3项，获得省级以上学科竞赛奖项近40项。