我校设有二级学院7个。

    护理学院：红河卫生职业学院前身为红河州卫生学校，始建于1958年，办学之初即设置了护理专业。目前有护理、助产、老年保健与管理、婴幼儿托育服务与管理4个专业，护理、助产专业有三年制大专、五年制2种层次，在校39个班，实习28个班，在校2125人，实习1563人，共3688人。截止2023年9月，为红河州乃至全省培养中职、高职护理学生约3万余人。

    临床与公共卫生学院：成立于2020年11月，目前招收有临床医学、预防医学、康复治疗技术、医学影像技术、医学检验技术、眼视光技术、中医康复技术、医学营养8个专业，其中临床医学、预防医学专业为国家控制专业。现有学生3000余人。

    药学院：成立于2020年11月，已有26年办学历史，目前招收有药学、中药学、药品经营与管理、药品生产技术4个专业，目前在校 生数为1929人，自升专以来，每年毕业生一次性就业率高，专业对口就业率达100%，先后培养6000余名药学专业人才。

    中医学院：成立于2020年11月，设有中医学、针灸推拿、医学美容技术、中医养生保健4个三年制大专的招生专业。现有18个班，学生930人。

   口腔学院：成立于2020年11月，设有腔医学、口腔医学技术、口腔卫生保健3个专业,。

   公共课部：成立于2014年6月，2022年开设有健康大数据管理与服务专业。

   体育部：成立于2014年，2024年开设体育保健与康复专业。

学校教职工总数489人，其中专任教师332人、硕士研究生学位专任教师111人、在职在编教师攻读博士学位6人，高学历人才比例达到33.43%；专任教师高级职称人数106人，其中正高级职称15人；“双师型”教师160人，“双师型”整体比例达56.74%，专业课教师中“双师型”教师比例达70.65%。外聘兼职教师221人。全生命周期健康护理团队、基层临床与公共卫生服务专业群团队、药学团队、口腔医学专业团队4支教学团队进入云南省职业教育教师教学创新团队立项建设。

截止2024年12月31日，学校共有在校学生11500余人。在校生：三年制8000余人，五年制2500余人