学校设有安定书院/创新创业学院、经济管理学院、马克思主义学院、教师教育学院、体育学院、人文学院、外国语学院、艺术学院、音乐学院、理学院、信息工程学院、工学院、生命科学学院、医学院/护理学院14个二级学院以及赵孟頫美术学院、沈家本法学院。

学校坚持以有组织科研提升科技创新能力和水平，获批国家语言文字推广基地、教育部中华优秀传统文化（蚕丝绸）传承基地、牵头筹建国家林业和草原局共同富裕长三角林业国家创新联盟等。现有16个省部级及以上科研创新平台。出版各类著作413部。主持获教育部人文社科优秀成果奖4项，主持获省自然科学奖一等奖、省科学技术进步奖一等奖、省哲学社会科学优秀成果一等奖共5项，其他省部级科研成果奖87项。

拥有一级学科硕士学位授权点4个、硕士专业学位授权点12个，与国内外10余所知名高校和科研机构联合培养博士研究生。计算机科学与技术学科入选浙江省一流学科（A类培育），教育学、数学、物理学、水产、护理学、设计学6个学科入选省一流学科B类。数学、工程学、临床医学、化学4个学科进入ESI全球前1%，数学学科进入软科世界一流学科排行榜。  

湖州师范学院是一所具有优良师范传统、鲜明应用特色的综合性大学，学科涵盖教育学、工学、农学、医学、理学、文学、经济学、艺术学、法学、管理学、历史学等11大学科门类。

学校持续实施人才强校首位战略，现有教职工1472人，专任教师博士占比69.68%。拥有外国科学院、工程院院士5人，共享院士2人，国家“万人计划”专家、国家杰青、国家百千万人才、国家教学名师等国家级人才16人，中科院“百人计划”人才、省“钱江学者”特聘教授、省“万人计划”专家等省级人才83人次。4位教授入围2022年全球学者学术影响力排行榜全球前10万名学者名单；13人次入选美国斯坦福大学发布全球前2%顶尖科学家2022榜单“终身科学影响力排行榜”“年度科学影响力排行榜”。

现有14个二级学院，全日制学生15000余人，其中本科生12880人，硕士研究生2185人，留学生176人；联合培养博士研究生32人。