拥有1个全国重点实验室、1个国家工程技术研究中心、1个国家发改委工程研究中心、1个省部共建国家重点实验室、1 个国家临床医学研究中心（眼科疾病）、2个教育部省部共建协同创新中心、1个国家药监局重点实验室、2个国家级国际科技合作基地、1个国家级中医药平台、36个省部级科研平台。2个浙江省“重中之重一级学科”，4个浙江省A类一流学科、6个B类一流学科，10个浙江省高校重点学科，2个浙江省重点建设学科。

学校拥有国家级一流本科专业建设点18个、国家级特色专业建设点4个、国家专业综合改革试点项目1个、教育部“卓越医生教育培养计划”试点项目5个、国家级人才培养创新实验区1个、国家级实验教学示范中心2个、国家级实践教育基地1个、国家临床教学培训示范中心1个、国家虚拟仿真实验教学中心1个；国家级一流课程23门、国家级精品资源共享课程5门、国家级双语教学示范课程1门、国家级来华留学生英语授课品牌课程2门、教育部首批课程思政示范课程1门，全国首届优秀教材二等奖1本（主编），全国教材建设先进集体1个；首批国家级虚拟教研室2个，国家级教学团队2个、国家级教学名师3人，教育部课程思政教学团队1个，教育部课程思政教学名师1人，国家级教学成果二等奖3项。

临床医学、基础医学、药学、生物医学工程一级学科博士点和临床医学、医学技术专业学位博士点。

临床医学、护理学、中药学、生物学、生物医学工程、基础医学、中西医结合、药学、医学技术、口腔医学、公共卫生与预防医学、公共管理等12个一级学科硕士点；临床医学、生物医学工程、口腔医学、护理、药学、公共卫生、应用心理等7个专业硕士学位授权点。

学校现有教职员工及医护人员15000余人（含附属医院），其中具有高级专业技术职务1800余人。学校本部现有专任教师1792人，其中具有正高级专业技术职务479人，具有副高级专业技术职务608人，博士学位1369人。有中国工程院院士1人、加拿大健康科学院院士2人、国家“杰青”项目获得者2人；一批优秀人才入选科技部中青年科技创新领军人才、省特级专家等，一批教师获国家科技进步奖、光华工程科技奖、何梁何利基金科学与技术奖、全国优秀教师、全国师德标兵、全国三八红旗手等荣誉。拥有教育部创新团队1个、全国高校黄大年式教师团队2个、科技部高等学校学科创新引智基地（111基地）2个。学校获评省重才爱才先进单位。

现有在校本专科生15203人（全日制，不含独立学院——温州医科大学仁济学院），研究生6445人（含博士研究生472人），学历教育留学生684人。学校已形成从本科生到硕士生、博士生及博士后，从全日制到成人教育、留学生和港澳台学生教育全方位、多层次的人才培养体系。