软件是新一代信息技术的灵魂，是数字经济发展的基础，是制造强国、网络强国、数字中国建设的关键支撑。南昌航空大学软件工程专业成立于2002年，是国家级一流本科专业、国家级特色专业、江西省首个通过中国工程教育专业认证的计算机类专业。软件工程一级学科在全国第五轮学科评估中被评为C+，江西省软件工程学科排名第1，是江西省软件工程学科联盟牵头单位。2021年江西省第二轮本科专业综合评价中排名第1，获批江西省五星级本科专业。2022年获批江西省“十四五”期间一流优势专业。截止2025年，获批国家级一流本科课程2门、省级一流本科课程5门、省级课程思政示范课1门、省级校企合作一流本科课程1门、省级虚拟教研室1个、省十四五规划教材1本和省级高水平本科教学团队1个。近五年，教学改革成果丰硕，共获江西省教学成果一等奖1项、二等奖2项、青年项目1项。2024年，在“软科中国大学专业排名”中位列全国前11.4%，评级为B+。

本专业设置软件设计与开发、飞行器控制技术两个专业方向，开设一个拔尖创新人才实验班——凌云班。

软件设计与开发方向系统学习软件工程基本知识和理论、工程化和智能化软件开发方法和技术，具备软件总体方案设计、高质量程序编写的能力，熟练掌握管理软件开发、网站设计、移动终端开发等技术，并能够熟练运用人工智能技术对软件进行重构和优化。

飞行器控制技术方向与本校飞行器设计与工程专业共同开展课程教学，学生除学习软件工程相关知识外，还将学习与飞行器控制相关的专业方向知识，具备将软件技术应用到飞行器控制领域的能力。毕业生将在航空航天所属科研院所及企业更具竞争优势。

软件工程凌云班开设于2021年，是软件学院深化本科教育教学改革，探索拔尖创新人才培养的重要平台，也是构建特色卓越工程师自主培养体系的创新举措。软件工程专业从大一本科生中选拔不超过30人组成“凌云班”。该班级采用“学习工场”、“小班教学”、“项目教学”等先进教育理念，将航空特色融入课程与实践，培养聚焦航空领域关键软件技术的特色化拔尖创新人才。