我校软件工程专业是国家级一流本科专业、国家级特色专业、江西省首个通过中国工程教育专业认证的计算机类专业。软件工程一级学科在全国第五轮学科评估中被评为C+，江西省软件工程学科排名第1，是江西省软件工程学科联盟牵头单位。2021年江西省第二轮本科专业综合评价中排名第1，获批江西省五星级本科专业。2022年，获批江西省“十四五”期间一流优势专业，2023年，获批首批江西省特色化示范性软件学院。

为解决国产软件“卡脖子”问题并探索特色化软件人才的培养路径，我校软件工程专业将设置一个25-30人的特色教学班（“凌云班”），该班将从2024级入校新生中择优选拔。特色班将采用“小班教学”、“学习工厂”、“产教融合”、“项目教学”、“本硕贯通”等先进教育理念和教学模式，增强学生社会责任感和民族使命感，培养学生解决复杂工程问题能力和创新意识。此外，特色班毕业时可优先推免本校研究生。

本专业设置软件设计与开发、飞行器控制技术两个专业方向。