学院开设基础医学院、中医药学院、生物医学工程学院、药学院、公共卫生学院、护理学院、检验与生物技术学院、卫生管理学院、马克思主义学院、外国语学院、法医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、广东省人民医院临床医学院、第三临床医学院、深圳临床医学院、口腔医学院、康复医学院、麻醉学院。

国家级、省部级研究机构设置：

1.实验室：

国家级：   省部共建“器官衰竭防治”国家重点实验室室

省部级：教育部重点实验室：器官衰竭防治重点实验室、精神健康研究重点实验室、国家药监局重点实验室：药物代谢研究与评价重点实验室、化妆品安全评价重点实验室重点实验室、 中药急症制剂基础实验室、分子生物学实验室、中药药理实验室、中药新器官衰竭防治重点实验室、精神健康研究重点实验室药研究实验室等40多个重点实验室。

2.研究中心（所）：

国家级：国家慢性肾病临床医学研究中心（全国科普教育基地）；国家健康医疗大数据研究院（国家健康医疗大数据人才培训示范基地）

省部级：教育部工程研究中心：数字化诊断治疗设备教育部工程研究中心；应对核化生恐怖医学防护教育部工程研究中心；脑血管病诊疗技术与器械教育部工程研究中心；教育部国别区域研究中心等40多个研究中心（创新平台）。

拥有5个国家重点及培育学科、6个国家中医药管理局重点学科、10个广东省重点学科

现有10个博士学位授权一级学科、15个硕士学位授权一级学科、2个博士专业学位授权类别、15个硕士专业学位授权类别、10个博士后科研流动站，形成了以医学为主，理学、工学、法学、管理学、教育学等多学科协调发展的学科体系。

现有国家级人才项目入选者353人次，省级人才项目入选者373人次，其中：两院院士4人、双聘院士12人，国家级教学团队3个，全国高校黄大年式教师团队2个，国家教学名师6人，国家海外高层次人才31人，长江学者38人，国家“杰青”31人，国家特支计划29人（青年拔尖人才10人），“百千万人才工程”国家级人选24人，科技部中青年科技创新领军人才10人，国家“优青”27人。

学校现有全日制在校本科生14140人、硕士研究生7058人、博士研究生1842人、留学生1008人。

2024年，预计学校继续面向31个省（自治区、直辖市）及港澳台地区招收40个本科专业（含方向）新生3000余人，研究生招生与本科生招生比例1:1。