吉首校区：1.通信与电子工程学院    2.化学化工学院    3.物理与机电工程学院    4.数学与统计学院    5.医学院    6.生物资源与环境科学学院    7.商学院    8.法学与公共管理学院    9.人文学院    10.文学与新闻传播学院    11.计算机科学与工程学院（软件工程专业目前在张家界校区）    12.药学院    13.马克思主义学院    14.音乐舞蹈学院    15.体育科学学院    16.吉首大学师范学院

张家界校区：17.美术学院    18.土木工程与建筑学院    19.旅游学院    20.外国语学院（商务英语专业目前在吉首校区）    21.民族预科教育学院 

学校有国家地方联合工程实验室——杜仲综合利用技术国家地方联合工程实验室，国家级实验教学示范中心——吉首大学化学实验教学中心，国家级工程实践教育中心——吉首大学-中软国际国家级工程实践教育中心，湖南省高校协同创新中心3个，省级示范中心、产学研合作示范基地8个，重点实验室、工程实验室、虚拟仿真中心14个，大学生创新创业教育基地与教育中心30个。

优势学科

ESI全球前1%学科：化学、工程学

湖南省国内一流建设学科：体育学

湖南省国内一流培育学科：民族学

湖南省优势重点特色学科：体育学、民族学、哲学、应用经济学、生态学

一级学科博士学位授权点：体育学

一级学科硕士学位授权点：应用经济学、工商管理、民族学、中国史、马克思主义理论、体育学、物理学、信息与通信工程、中国语言文学、化学、生物学、生态学、统计学、基础医学、数学、新闻传播学、计算机科学与技术

硕士专业学位授权类别：体育硕士、临床医学硕士、艺术硕士、法律硕士、翻译硕士、新闻与传播硕士、教育硕士、电子信息硕士、旅游管理硕士、图书情报硕士、工商管理硕士、会计硕士、材料与化工硕士、资源与环境硕士、生物与医药硕士、护理硕士、风景园林硕士、音乐硕士、舞蹈硕士、设计硕士

优势专业

国家级特色专业：工商管理、生物科学、音乐学

卓越医生教育培养计划专业：临床医学

国家级本科专业综合改革试点专业：工商管理

卓越农林人才教育培养计划专业：园林

国家级一流本科专业建设点：体育教育、软件工程、物理学、汉语言文学、旅游管理、计算机科学与技术、化学、武术与民族传统体育、经济学、英语、网络与新媒体、数学与应用数学、生物科学、食品科学与工程、工商管理、音乐学

省一流本科专业建设点：法学、新闻学、通信工程、临床医学、舞蹈学、环境设计、商务英语、历史学、数字媒体艺术、会计学、环境工程、城乡规划、土木工程、机械设计制造及自动化、药学、护理学、针灸推拿学、思想政治教育、电子信息工程、小学教育

与中山大学联合培养专业：数学与应用数学、物理学、化学、生物科学、汉语言文学、历史学、公共事业管理、法学、工商管理

省级专业综合改革试点专业：软件工程、新闻学、临床医学

学位授予层次有：学士学位；硕士学位；博士学位。

学位授予门类有：法学、管理学、历史学、哲学、文学、经济学、理学、工学、医学、农学、艺术学、教育学。

学校在职教职员工近1500人，专任教师1100余人，其中高级职称700余人，博士生导师、硕士生导师共560余人。有“国务院政府特殊津贴”专家14人，“新世纪百干万人才工程”国家级人选1人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”6人，文化名家暨“四个一批”人才工程1人、国家民委民族问题研究优秀中青年专家1人、湖南省“121人才工程”人选、享受“湖南省政府特殊津贴”专家、湖湘青年英才、湖南省芙蓉学者、湖湘高层次人才聚集工程人选、湖南省跨世纪学术带头人、湖南省“芙蓉教学名师”、湖南省优秀中青年专家等共51人；有国家级教学团队2个，省级优秀教学团队3个，省级科技创新团队4个。有全国先进教育工作者1人，五一劳动奖章2人，全国优秀教师9人，全国师德先进个人1人，全国模范教师1人，徐特立教育奖获得者1人；曾宪梓教育基金奖获得者5人；宝钢教育基金奖获得者2人。

学校现有各类在籍学生3万余人，其中在校本科生、硕士生、博士生、留学生共2.5万人。