学校现有梅山路、翡翠路、东校区和新医科中心（在建）等4个校区。在职教职医护员工（含直属附院）1.62万人，其中校本部教职工1907人。拥有研究生学院、基础医学院、公共卫生学院、口腔医学院、卫生管理学院、药学院、护理学院、马克思主义学院、生命科学学院、生物医学工程学院、第一临床医学院、第二临床医学院、巢湖临床医学院、国际教育学院、人文医学学院、继续教育学院、第五临床医学院、精神卫生与心理科学学院、法学院、临床药理研究所等20个直属教学机构。拥有第一附属医院、第二附属医院、附属口腔医院、附属巢湖医院、附属阜阳医院等5所直属附属医院，另有安徽省公共卫生临床中心（安徽省传染病医院、第一附属医院北区）和6所共建附属医院、3所非直属附属医院、3所医学中心、3所附属疾病预防控制中心，医联体合作单位300余家，构建起覆盖全省、辐射周边、贯穿“全生命周期”的安医系健康服务体系。

学校建有较为完备的科技创新平台体系，现有省部级科技平台61个，其中安徽省实验室1个，部委级科技平台8个（教育部重点实验室3个，国家卫生健康委重点实验室1个，教育部工程研究中心1个，教育部基础研究创新中心1个，教育部国际合作联合实验室1个，教育部、科技部科创新引智基地1个）、其他省级科技平台52个。

  学校医学及相关学科门类齐全，已形成学士、硕士、博士完整的教育培养体系。当前学校共有48个本科专业，覆盖医学、理学、管理学、工学、法学等5个专业门类。共有基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学博士学位授权一级学科4个，博士学位授权二级学科45个，马克思主义理论、心理学、生物学、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、中药学、特种医学、护理学、公共管理等硕士学位授权一级学科13个，硕士学位授权二级学科79个，临床医学博士专业学位授权类别1个，临床医学、口腔医学、公共卫生、药学、中药学、护理、医学技术、电子信息、应用心理等硕士专业学位授权类别9个。建有药学、临床医学、公共卫生与预防医学、基础医学4个博士后科研流动站。药学、公共卫生与预防医学、临床医学、生物学、基础医学等5个学科获批安徽省高等学校高峰学科。护理学、生物医学工程、心理与脑科学获批安徽省高峰培育学科立项建设。临床医学、药理学与毒理学、分子生物学与遗传学、生物与生物化学、免疫学、神经科学与行为学、环境科学与生态学、社会科学总论、精神病学与心理学、材料科学、化学11个学科进入ESI全球排名前1%。

学校医学及相关学科门类齐全，已形成学士、硕士、博士完整的教育培养体系。当前学校共有48个本科专业，覆盖医学、理学、管理学、工学、法学等5个专业门类。共有基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学博士学位授权一级学科4个，博士学位授权二级学科45个，马克思主义理论、心理学、生物学、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、中药学、特种医学、护理学、公共管理等硕士学位授权一级学科13个，硕士学位授权二级学科79个，临床医学博士专业学位授权类别1个，临床医学、口腔医学、公共卫生、药学、中药学、护理、医学技术、电子信息、应用心理等硕士专业学位授权类别9个。建有药学、临床医学、公共卫生与预防医学、基础医学4个博士后科研流动站。

目前学校全日制在校生总规模为2.68万人，其中本科生18415人，硕士研究生7311人，博士研究生740人，留学生307人。