学校现有1个国家重点实验室、1个国家级国际联合研究中心、28个部省级重点实验室（工程中心、智库）、2个省级协同创新中心。拥有国内一流的医学模拟教育中心（MSC）和自主学习中心以及国内知名、省内一流的江苏省医药动物实验基地，建有江苏省唯一的省级卫生政策智库健康江苏研究院以及省内唯一的转化医学研究机构江苏省转化医学研究院。

学校现有一级学科博士学位授权点8个（生物学、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、药学、医学技术、护理学）、二级学科博士学位授权点54个、3个交叉学科博士学位授权点（临床医学工程、人文医学、健康政策管理）；一级学科硕士学位授权点11个、二级学科硕士学位授权点65个；博士后科研流动站7个，学位授权点已覆盖医学、理学、工学、管理学、法学、教育学和文学等7个学科门类；拥有3个国家重点学科、1个国家重点培育学科、29个国家临床重点专科、6个江苏高校优势学科（三期）、2个江苏省一级学科重点学科、3个江苏省一级学科重点培育学科。在全国第四轮学科评估中，我校公共卫生与预防医学在全国54所参评高校中获评A+等级。临床医学、分子生物学与遗传学、生物学与生物化学、神经科学与行为学、药理学和毒理学、免疫学、社会科学总论、化学等8个学科进入ESI全球排名前1%，其中，临床医学学科进入ESI全球排名前1‰。 

南京医科大学现有博士、硕士学位授权点

博士学位授权点（7个一级学科、1个二级学科、1个交叉学科）：

（一）一级学科

基础医学（人体解剖与组织胚胎学，免疫学，病原生物学，病理学与病理生理学，法医学，放射医学，航空、航天与航海医学、生殖医学）

临床医学（内科学，儿科学，老年医学，神经病学，精神病与精神卫生学，皮肤病与性病学，影像医学与核医学，临床检验诊断学，外科学，妇产科学，眼科学，耳鼻咽喉科学，肿瘤学，康复医学与理疗学，运动医学，麻醉学，急诊医学）

口腔医学（口腔基础医学，口腔临床医学）

公共卫生与预防医学（流行病与卫生统计学，劳动卫生与环境卫生学，营养与食品卫生学，儿少卫生与妇幼保健学，卫生毒理学，军事预防医学、卫生检验学、社区医学与健康教育学）

药学（药物化学，药剂学，生药学，药物分析学，微生物与生化药学，药理学、临床药学）

特种医学（特种医学）

护理学（护理学）

（二）二级学科

生物化学与分子生物学

（三）交叉学科

人文医学

硕士学位授权点（11个一级学科、2个二级学科）：

（一）一级学科

心理学（基础心理学，发展与教育心理学，应用心理学）

生物学（植物学，动物学，生理学，水生生物学，微生物学，神经生物学，遗传学，发育生物学，细胞生物学，生物化学与分子生物学，生物物理学，生态学）

生物医学工程

基础医学（人体解剖与组织胚胎学，免疫学，病原生物学，病理学与病理生理学，法医学，放射医学，航空、航天与航海医学）

临床医学（内科学，儿科学，老年医学，神经病学，精神病与精神卫生学，皮肤病与性病学，影像医学与核医学，临床检验诊断学，护理学，外科学，妇产科学，眼科学，耳鼻咽喉科学，肿瘤学，康复医学与理疗学，运动医学，麻醉学，急诊医学）

口腔医学（口腔基础医学，口腔临床医学）

公共卫生与预防医学（流行病与卫生统计学，劳动卫生与环境卫生学，营养与食品卫生学，儿少卫生与妇幼保健学，卫生毒理学，军事预防医学）

药学（药物化学，药剂学，生药学，药物分析学，微生物与生化药学，药理学）

特种医学（特种医学）

护理学（护理学）

公共管理（行政管理，社会医学与卫生事业管理，教育经济与管理，社会保障，土地资源管理）

（二）二级学科

思想政治教育，中医内科学

 

学校校本部现有在职教职工1800多人，其中学校编制专任教师952人。有教授302人、副教授255人，有博士生导师720人、硕士生导师2317人。学校现有中国工程院院士2名，美国国家医学院外籍院士1名，“长江学者奖励计划”特聘教授3名、青年学者2名，国家百千万人才工程7人，国家杰出青年科学基金获得者10人，优秀青年基金获得者16人，国家级教学名师1人，全国优秀教师1人，全国模范教师1人，江苏特聘教授32人，“国家级教学团队”3个，教育部“创新团队”1个。

目前，学生总数为1.9万多人，已形成从本科生、研究生到博士后，从全日制到成人教育、留学生教育全方位、多层次的教育体系。