我校于2003年9月整体东迁浦东张江。目前学校位于浦东张江高科技园区科研教育区内，占地面积（包括生活区）650多亩，是我校原零陵校区、东安校区、奉贤校区总面积的3倍左右。校园环境优美，教学设施齐全，总建筑面积156800平方米，建有教学楼、实验楼、图书信息楼、行政楼、外事楼、体育中心、博物馆楼等。新校区东邻金科路，西邻科苑路，北傍吕家浜，南靠蔡伦路，离地铁二号线张江站步行约20分钟路程，徐川线、唐川线等公交线路可到达地铁二号线张江站，大桥五线、大桥六线、张南线等公交线路均可直达学校门口。

新校区还拥有现代化的教学、运动设施。所有教室都安装了网络接口；配备标准塑胶跑道的体育场、游泳馆、室内体育馆、网球场等运动设施。除教学楼以外，并建有科研实验中心（内有各类先进的科研仪器）、教学实验中心（内有设施一流的模拟医院、全天候开放的各类学生实验室），为学生提供了良好的技能培训条件。新校区将努力建成数字化校园，实现学生管理信息化，并将提供大量的网上教学资源。学生生活区设施较齐全，实行统一社会化管理。

新校还建有一流的图书信息大楼和医史博物馆，我校博物馆也是上海市科普教育基地，成为上海市大中小学生开展中国优秀传统文化教育的重要基地。2004年，我校附属医院曙光医院也搬迁至张江高科技园区科研教育区内，并将建成上海四大标志性医院之一，为学生的临床实践提供保障。同时，我们将依托张江“药谷”的优势和资源，在浦东形成中医教育、医疗与中药研发基地，与张江高科技园区“产－学－研”技术创新体系相结合，发展成为开放性、多元化的学术、信息、人才、技术中心，必将为我国的中医药事业作出更新、更大的贡献。