分子科学与工程专业以我校航空、航天、航海等独特的平台及学科优势，深厚的军工、国防建设为背景，面向国家和国防的重大需求，构筑学生利用分子科学、分子工程的理论和研究方法，在分子水平上设计和制造新物质、研制新型功能材料、建立先进工业过程等方面的知识体系，进而为国防科技所涉及的各种化学、材料、新能源及动力等宏观工程领域的关键技术提供基础性科学支撑。

培养具有较强的全球视野与持久竞争力、团队合作、创新实践等能力，具有健康体魄、高尚品格、追求卓越的精神、高度的社会责任感及家国情怀，毕业后能在化学、材料、能源及国防等领域从事基础研究、设计研发、制造与应用、教育教学、管理决策等工作的“总师型”人才。

毕业生可报考包括本校在内的国内外名校的化学、高分子化学与物理、材料学等相关专业的硕士研究生。毕业生可选择石油化工、电子电器、航空、航天、医药等企事业单位、大专院校、化学研究部门及有关高新技术领域从事教学、科学研究、技术开发、生产技术管理和市场开发等工作。