土木工程（与香港大学合作办学）该专业由应用力学与工程系和香港大学土木工程系联合培养。全体学生入学后在中山大学广州东校区就读。第一个学期的所有课程原则上能在第一学年度二月底前考试通过并经过香港大学考核合格，有能力承担香港大学学费和生活费的学生由香港大学录取，第二学年第一学期以交换生的形式在香港大学就读；第二学年第二学期回到中山大学就读半年；之后回到香港大学完成学业。

除政治理论课和素质教育课外，其它课程的教学及考试均采用英语。学生修满学分、各科考试合格并符合学位条例要求者，中山大学颁发“土木工程”专业毕业证书，香港大学颁发“土木工程学士”学位证书。第二年未能赴香港大学注册留在中山大学就读的学生，原则上编入应用力学与工程系“理论与应用力学”专业继续学习,按“理论与应用力学”专业要求培养。 

在中山大学学习期间的学费为30000元/年/人，在香港大学学习期间的学费不低于119000港元/年/人。 
在中山大学学习期间主要课程：大学语文(College Chinese), 高等数学(Advanced Mathematics)，普通物理(General Physics), 物理实验(Physics Experiments), Theoretical  Mechanics (理论力学)、Engineering Mathematics I,II（工程数学I，II）、Structural mechanics(结构与材料力学力学)、Fluid Mechanics(流体力学)、Strength Experiment(工程力学实验)、Environmental engineering (环境工程)、工程制图与测量学 (Engineering Drawing and Surveying)、 Computational Method（计算方法）等。 
在香港大学学习期间主要课程： Construction Materials(建筑材料), Theory and design of structure I, II(结构理论与设计I, II)、Professional and technical oral communication for engineers(工程师专业会话)、Professional and technical written communication for engineers(工程师专业写作)、Engineering design and communication(工程设计与沟通)、Hydraulics and hydrology(水力与水文学)、Engineering geology and rock mechanics(工程地质与岩石力学)、Principles of civil engineering management(土木工程管理原理)、Soil mechanics(土力学)、Traffic engineering(交通工程)、Construction project management(工程项目管理)、Inter-disciplinary design project(跨专业设计实习)、 Engineering hydraulics(工程水力学)、Foundation engineering(地基工程)、Industrial Training(工程实习)等。