建筑系创建于1987年，其前身为上海大学建筑工程学院建筑学专业，于2000年院系调整并入美术学院，开创了国内美术院校办建筑系之先河。建筑现任主任为刘勇教授。现设有建筑学、城乡规划两个5年制本科专业，每年招收本科生（理工类）90名左右；设有建筑学一级学科硕士点（覆盖建筑学和城乡规划两大方向）。每年本科毕业生大约有20%左右出国前往美国哥伦比亚大学、英国伦敦大学学院等国外著名建筑院校继续深造，30%左右推免或考取同济大学、东南大学、南京大学等国内著名建筑院校继续深造。建筑系在专业建设与学科发展方面始终坚持与美术学院艺术学科有机融合，坚持“工程技术与艺术”相结合，坚持探索“技艺融合”的理论研究与实践创作，并以学科建设为引领培养具有良好艺术感觉、艺术原创力，具备完善的专业知识结构的专业人才。学生作业和作品在包括“全国建筑院系大学生建筑设计竞赛”、中国建筑教育“清润奖”大学生论文竞赛等重要活动中获奖百余次。近年建筑系教师主持国家级、省部级课题20余项，发表论文300余篇，出版专著、教材50余部。依托上海上大建筑设计院有限公司和上海大学科研处，承担横向项目和课题70余项，在上海市建筑与环境艺术设计、建筑营建技艺与旧城更新、地铁空间设计与建设、公共空间建设与公共艺术结合方面发挥着重要作用。

2007年建筑系设立四年制城市规划专业（理工类），至2009年共招收三届城市规划专业学生；2014年设立五年制城乡规划专业（理工类）。

依托上海大学浓厚的人文社科和艺术学科优势，强调理工专业与学校优势专业的融汇贯通，特别强调在城乡规划专业教育过程中与社会学、设计学以及公共艺术等优势专业和学科的联合，促进专业培养过程中的融贯教育，培养具有“哲人思辨、文人情怀、匠人智慧”的人文规划师。

围绕上海及长三角地区城乡发展需求，培养具有独立思考及创新能力，具备较扎实自然科学、人文社科基础，熟练掌握空间设计与规划基本理论和表达技能，具备较高的审美能力和较强的动手能力，能在城乡规划设计、规划管理、咨询决策、房地产开发等部门从事城乡规划设计与管理、城市开发及各项城市专项规划设计，兼具问题意识、战略思维、协同创新、科学素养与较高人文艺术底蕴的高级应用型人才。