学校设有农学院、植物保护学院、动物科学学院、动物医学学院、草业学院、林学院、资源环境学院、园艺学院、农业工程学院、食品科学与工程学院、农业经济管理学院、信息科学与工程学院、公共管理学院、生命科学学院、软件学院、城乡建设学院、基础部。

学校（院）牢固树立“创新为上”的发展理念，打造一流创新生态，提升科技创新能力。目前，依托学校（院）建设国家高粱产业技术创新战略联盟、黄土高原东部旱作节水技术国家地方联合工程实验室、退化土壤改良与新型肥料研发国家地方联合工程研究中心、园艺植物脱毒与繁育技术国家地方联合工程研究中心、黄土高原特色作物优质高效生产省部共建协同创新中心、国家枣葡萄种质资源圃（太谷）、国家特色杂粮作物种质资源中期库（太原）、国家功能杂粮技术创新中心等国家级平台8个，农业农村部学科群重点实验室、省重点实验室、省“1331工程”创新平台等省部级平台（基地、资质）159个。科技部、农业农村部和山西省科技创新团队38个。“十三五”以来，获得国家科技进步奖二等奖3项，省部级一等奖17项、二等奖83项；取得国家审（鉴）定品种53个、省级审（认）定品种506个，国家标准4个、行业标准5个、地方标准466个，国家植物新品种权73项。主管主办《山西农业大学学报（自然科学版）》等7本出版物。

现有9个博士后科研流动站，9个博士学位授权一级学科，1个博士专业学位授权类别；13个硕士学位授权一级学科，8个硕士专业学位授权类别。学科专业涵盖了农学、理学、工学、经济学、管理学、文学、法学、艺术学等8个门类，拥有本科专业68个。初步构建了以农科为核心、向上游生物学科和下游食品学科双向延伸、其他相关学科为支撑的学科体系。现有动物遗传育种与繁殖1个国家重点（培育）学科，农业工程、作物学、园艺学、农业资源与环境、植物保护、畜牧学、兽医学、林学、草学等9个省级重点学科。植物学与动物学、农业科学、环境与生态科学三个学科进入ESI全球前1%。

学校可授予农学、理学、工学、文学、法学、经济学、管理学、艺术学等学士学位

学校（院）坚持实施“人才优先、人才强校”战略，为改革发展事业提供了强有力的人才支撑。现有教师、科研人员及职工4374人，其中正高级专业技术人员517人，副高级专业技术人员1443人，博士生导师175人，硕士生导师1196人。现有中国工程院院士1人，国际欧亚科学院院士1人，“长江学者”特聘教授1人，“国家杰出青年科学基金”获得者2人，国家高层次人才特殊支持计划领军人才项目获得者1人、教学名师项目获得者1人，“国家优秀青年科学基金”获得者1人，百千万人才工程国家级人选4人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者3人，国务院学位委员会学科评议组成员1人，享受政府特殊津贴83人，国家现代农业产业技术体系副首席2人、岗位科学家17人，农业农村部农业科研杰出人才2人、神农青年英才3人，“青年三晋学者”7人，省青年拔尖人才8人，省学术技术带头人63人，省科技功臣6人。国家级教学名师1人，全国优秀教师3人，教育部高等学校教学指导委员会委员11人，全国林业和草原教学名师2人，省级教学名师29人。

学校（院）现有在校生3万余人。