哈尔滨商贸职业学院内设服务管理机构、教学机构和教学辅助机构共计24个部门。

服务机构13个：

党委工作部、纪检监察处、党政办公室、人事处、财务处、总务与资产管理处、教务处、质量保障中心、学生工作处、保卫处、招生就业处、国际合作交流处、科研产业发展处。

教学机构8个：

1.经济贸易学院（开设跨境电子商务、智能物流技术专业）；

2.现代服务学院（开设大数据与会计、智慧旅游技术应用专业）；

3.智慧医护学院（开设护理、智慧健康养老服务管理专业）；

4.马克思主义学院；

5.通识教育学院；

6.创新创业学院；

7.继续教育学院；

8.中俄合作教育学院。

教辅机构3个：

实训中心、图书馆、数字网络中心。

哈尔滨商贸职业学院拥有一支结构合理、素质优良的教师队伍。目前，学院现有专任教师共计134人，其中全职专任教师102人，兼职专任教师32人。全职专任教师中，本科以上学历102人，其中硕士19人，博士5人；中级职称11人，副高级以上职称82人，副高级以上职称占全职专任教师总数80.4%；“双师型”专任教师41人，占专任教师总数41.2%，其中：中级以上“双师型”教师35人，占全职专任教师总数34.3%。每个专业都配备了1名副高级以上专业技术职务的专业带头人，全部具有10年以上高校教育教学管理经验和带领本专业发展建设工作经历。按照教育部《高等学校思想政治理论课建设标准》配备了10名硕士研究生专职德育工作者，所学专业均为思政类。按照教育部《普通高等学校辅导员队伍建设规定》配备了专职辅导员，全部为统招本科学历，中共党员，学士学位，且具有多年的职业院校学生管理工作经验。