我校本科毕业生就业情况呈现就业质量高、工作岗位相关度高、用人单位满意度高等特点。武书连近三年的中国大学本科毕业生质量排行榜中，我校均为B+等级，均位列福建省前3名。许多校友成为我国尤其是福建省医疗卫生战线的领军人物和骨干力量。近年来，学校本科毕业生升学率稳居全省前列，2022-2024年分别为43.60%、48.97%，48.77%。其中，临床医学专业学生升学率高于60% （2022年 62.50%，2023年64.92%，2024年62.56%）。