学校设有国家奖学金、国家励志奖学金、省政府奖学金、东海奖学金、王成海奖学金、杨詠曼奖学金、海燕奖学金、优秀学生奖学金等10余种奖助学金。

学校设有家庭经济困难学生专项资助经费。报到时，家庭经济困难学生持《浙江省学生资助对象认定申请表》通过“绿色通道”直接办理入学手续。入学后，根据《浙江海洋大学学生资助办法》，学校将对家庭经济困难学生进行资格认定。经学校认定的资助对象可以通过申请国家助学金、国家助学贷款、勤工助学和困难补助等多种渠道获得资助。