北京协和医学院的八年制临床医学专业的招生计划纳入清华大学的总招生计划之中，由两校共同完成招生录取工作。该专业采用清华大学的招生代码，录取原则与清华大学的录取原则相同。

护理学、药学专业的录取工作由北京协和医学院单独完成。学生在思想政治品德考核和身体健康状况检查合格，统考成绩达到各省、市、自治区同批录取控制线的情况下，按招生计划的100%调阅学生档案。对符合提档要求的学生，采取从高分到低分的顺序录取。我校承认教育部加分，在高考实际成绩总分相当的情况下，优先录取政策上同等优先和相关科目分数高的学生。

    临床医学专业纳入清华大学招生，加分政策与清华大学的政策相同。

    护理学、药学专业的录取工作由北京协和医学院完成。学校承认教育部加分，按高分到低分排列录取。

    均可录取往届生源。

    临床医学专业的同学大一、大二阶段在清华大学学习，可以参加清华大学的转专业。大三下学期回到协和校本部后，将不能再转专业。
    护理学、药学专业的同学根据我校相关管理办法转专业。