学院依托安徽医科大学雄厚的师资力量和办学资源，结合医疗健康事业的发展需求，先后建立了临床医学系、护理系、医学技术系、药学与生物医学工程系、公共卫生与卫生管理系、基础医学部、马克思主义学院、公共课程部与实验实训中心；现设有临床医学、护理学、助产学、药学、生物医学工程、公共事业管理、眼视光学、医学检验技术、医学影像技术、康复治疗学、健康服务与管理、预防医学、智能医学工程、生物医药数据科学14个本科专业。

学生完成规定课程和实习内容，经考核合格准予毕业，发放由教育部注册的安徽医科大学临床医学院毕业证书，符合学位授予条件者可按国家有关规定授予安徽医科大学临床医学院相关学科的学士学位。

安徽医科大学临床医学院依托安徽医科大学雄厚的师资力量和教学资源办学，安徽医科大学选派拥有丰富教学、临床和科研经验的教师负责专业课教学。在大学支持下，学院已经建立了一支专业水平高、教学能力强、爱岗敬业的教师队伍。