每年推荐优秀本科生外出交流学习、联合培养。学校有赴国内高校插班学习交流或联合培养机制。北京大学、华中科技大学、华东理工大学等9所知名高校对口支援石河子大学。通过“1+2+1”联合培养、“1+1+2”插班学习、推免研究生、暑期学习实践等途径，每年选送优秀本科生到北京大学、重庆大学、江南大学、对外经济贸易大学、华南农业大学、南京师范大学、西安电子科技大学、西安外国语大学、西北农林科技大学等高校学习交流。