学校实行灵活的转专业政策，除船舶与海洋工程（中外合作办学）、定向招生（小学教育师资定向、阿克苏定向）、单考单招、中本一体化和专升本学生不能申请转专业外，其他录取批次或其他专业的学生有3次转专业的申请机会，第一次在大一第二学期末（期末前完成选拔）；第二次和第三次分别在大二第一学期末和第二学期末（均在期末前完成申请和选拔）；每位学生最多只能转1次。偏文的师范类、经管类专业竞争相对比较激烈，其他专业相对容易，但大部分专业会要看学生的在校学习成绩（比如要求成绩在班级前30%等）、部分专业会有笔试或者面试，具体要求以等当年度学校教务处发布的转专业通知为准。