本科各专业学生在入学一年后，按学校相关要求提出转专业申请，目前各专业转出人数比例为5%。学校根据授予学位类别将专业分为授予医学学士学位专业（Ⅰ类专业）和授予非医学学士学位专业（Ⅱ类专业）两类。 Ⅰ类专业：临床医学(于维汉班)、基础医学(伍连德班)、临床医学(“5+3”一体化，含儿科学)、基础医学(“5+2”本硕连读)、临床医学(含俄语班)、麻醉学、医学影像学、儿科学、口腔医学、预防医学、法医学等11个专业。 Ⅱ类专业：生物技术、生物信息学、临床药学、生物医学工程、药学、护理学、法学、公共事业管理等8个专业。 转专业只能在I类专业之间、Ⅱ类专业之间互转，I类专业和Ⅱ类专业之间不能转；I类专业中本科各专业学生不能转入长学制临床医学(于维汉班)、基础医学(伍连德班)、临床医学(“5+3”一体化，含儿科学)和基础医学(“5+2”本硕连续培养)专业；长学制基础医学(伍连德班)和基础医学(“5+2”本硕连续培养)专业学生只能转入I类专业中本科各专业。 本办法自2021级学生开始实施，其他年级学生按原办法执行。