学校1978年开始招收硕士研究生，1981年成为我国首批硕士学位授权单位，2003年成为博士学位授予单位，2007年获批首个博士后科研流动站。学校学科特色鲜明、门类齐全，涵盖工学、理学、经济学、管理学、文学、法学、艺术学和教育学等8个学科门类，现有交通运输工程、土木工程、环境科学与工程、机械工程、测绘科学与技术等5个博士后科研流动站，有交通运输工程、土木工程、环境科学与工程、机械工程、管理科学与工程、测绘科学与技术等6个博士学位授权一级学科，有25个硕士学位授权一级学科、15个硕士专业学位授权类别。2017年5个学科（群）入选甘肃省一流学科建设项目，其中包括2个优势学科、3个A类特色学科；2019年6个学科入选甘肃省“双一流”特色建设工程项目，其中Ⅱ类学科1个、Ⅲ类学科3个、Ⅳ类学科2个。现有24个省级重点学科，占学校目前学科总数的92.3%。教育部第三轮学科评估“交通运输工程”学科排名第8位；第四轮学科评估中，学校交通运输工程、土木工程、环境科学与工程3个学科被评为B类（排名20%～30%）学科，机械工程学科被评为B-类（排名30%～40%）学科，信息与通信工程、化学工程与技术2个学科被评为C-类（排名60%～70%）学科。“工程学”“化学”学科进入ESI全球学科排名前1%。

土木类的相关专业均可报考其研究生，我校土木类相关专业：土木工程、工程管理、水利水电工程、工程造价、铁道工程、道路桥梁与渡河工程、工程力学等。