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水利类包含水利水电工程、港口航道与海岸工程两个专业，按照2+2模式实行大类招生分流培养，第五学期按照学业成绩、综合表现、个人特长等分流到大类所含专业学习。
港口航道与海岸工程专业
专业概况：本专业创建于1960年，是我国最早举办的港航专业之一，2007年被评为重庆市特色专业，2009年被评为国家级特色专业、并获批为第一批国家级人才培养模式创新实验区，2011年入选教育部“卓越工程师教育培养计划”试点专业,2012年获批水利工程博士后流动站和教授评审权，2013年入选重庆市“三特行动计划”首批特色专业建设点，2014年通过全国工程教育专业认证，2017年获批为交通运输部港口与航道工程基础设施建养技术创新人才培养示范基地。2017年顺利通过全国工程教育专业认证复评工作，2019年入选国家一流专业建设目录。专业连续两次被评为重庆市优秀重点学科。
本专业始终坚持“河海兼顾”、“港航并重”的专业建设思路，形成了特色明显、优势突出的内河港口、航道、枢纽和水运经济等特色鲜明的专业研究方向。研究成果涵盖全国85%的河流；形成了3支重庆市教学团队和3支西部创新团队的高水平师资队伍，拥有国家内河航道整治工程技术研究中心和国家工程实践教育中心等10余个国家级和省部级教学科研平台；校企协同育人机制成熟，与国营大型企业联合开展PPP投融资人才班、海外项目管理人才培养班，人才培养质量高，受到社会的广泛好评，毕业生初次就业率连续10年超过95%。
培养目标：本专业是培养适应经济社会发展需要，德智体美劳全面发展，具有良好的社会责任感和职业道德，掌握港口航道与海岸工程领域及其他相关工程领域的相关原理和知识，具有工程管理、技术经济和人文科学等方面知识，获得工程师良好训练，基础理论扎实，专业知识宽厚，实践能力突出，具有继续学习能力、创新能力、组织协调能力、团队精神和国际视野的高级工程技术人才和管理人才。本专业属于工学学科，基本学制4年，毕业学分为180学分。毕业后学生具备“治河筑港”的基本能力，能够胜任港口航道与海岸工程项目的勘测、设计、施工、管理和应用研究等工作；通过短期在岗学习或实践后，也能胜任土木工程、水利工程、海洋工程、市政工程等相近专业的勘测、设计、施工和管理等工作。
水利水电工程专业
专业概况：水利水电工程专业创办于2001年，为重庆市唯一培养水利水电类高级人才的本科专业，2015年实行水利类大类招生。本专业遵循“厚基础、强能力、高素质、重创新”的育人理念，培养在施工管理、工程设计方面具有较强的能力，主要在水利工程、土木工程行业的施工、设计和管理部门从事等规划与设计、建设与管理、技术咨询和科学研究等工作的高素质应用型人才。
本专业依托国家工程技术研究中心和十余个市级科研平台开展建设，形成了“本-硕-博”一体化的人才培养体系。专业2011年被评为重庆市特色专业建设点，2012年获批为重庆市“专业综合改革试点”专业和重庆市“大学生校外实践教育基地”建设点，2013年入选教育部“卓越工程师教育培养计划”试点专业和重庆市“三特行动计划”首批特色专业建设点，2019年入选重庆市“一流专业”建设点。专业所在水利工程学科2010年获一级学科博士授权点，2018年在教育部第四轮学科评估中进入“B”等级。
培养目标：培养适应经济社会发展需要，德智体美劳全面发展，具有扎实的自然科学、人文科学基础，具备外语和计算机应用技能，获得工程师的基本训练，掌握水利水电工程勘测、规划、设计、施工、科研和管理等方面的专业基本知识与专业技能，知识面宽、能力强、素质高的高级工程技术人才及管理人才。
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