梅河口康美职业技术学院设有三个教学系，承担全校各专业的专业课教学任务。 

梅河口康美职业技术学院护理康复系归属二级学院建制，成立于2019年。目前设有三年制高职层次的护理、助产、中医养生保健、康复治疗技术四个专业。所开设专业紧密依托市场需求办学，以就业为导向、以能力为本位、以岗位为依据，以学生职业能力和综合素质为主线，形成特色鲜明、行之有效的人才培养模式。 护理康复系全体教师坚持贯彻党的教育方针和基层卫生教育工作方针，坚持面向基层、服务社会的办学理念，以教学科研为中心、以师资队伍建设为依托,以课程建设为基础,以提升人才培养质量为根本,提高学生综合素质和实践能力，培养具有创新精神的应用技能型护理和康复人才。

梅河口康美职业技术学院药学系归属二级学院建制，成立于2019年。目前设有三年制高职层次的药学、中药学两个专业。所开设专业紧密依托属地医药健康行业需求办学，以就业为导向、以能力为本位、以岗位为依据，以学生职业能力和综合素质为主线，形成特色鲜明、行之有效的人才培养模式，目前已和药品相关企业达成深度产教融合。下辖药学实训中心，并建有中药种植基地和6个校外教学实践基地，能有效满足药学系全体学生的所有校内、外教学实训需求。

梅河口康美职业技术学院医学技术系归属二级学院建制，2019年成立。目前设有三年制高职层次的医学影像技术、医学检验技术、口腔医学技术专业。拥有一支爱岗敬业、综合素质高、结构合理、教学经验丰富、学术水平较高的专兼职教师队伍。现已和相关企业建立了深度产教融合育人新模式。   医学技术系自成立以来，全体教师锐意进取，积极开展教学改革。坚持以服务为宗旨、就业为导向、能力为本位、学生为中心、以提高教学质量为重点，正努力探索在新形势下的高素质技能型医学检验技术和医学影像技术类专门人才培养模式。

开设有护理、助产、医学检验技术、医学影像技术、康复治疗技术、中药学、药学、中医养生保健、口腔医学技术九个专业。

学生完成培养方案要求的教学内容，成绩合格，符合毕业条件，高职毕业生由梅河口康美职业技术学院颁发国家规定的专科(高职)毕业证书。

学院现有教师中高级职称占比达53.8%；具有双师型素质的教师占比达51.7%；有三甲级医院兼职教师近百人。建立了省内知名专家和学院骨干教师组成的专业带头人团队。由三甲医院主任医师、全国特色技术传承人、省市学科带头人等承担专业实训课教学内容，使学生从专业学习到实际工作实现无缝对接。