设有医疗护理系、经济管理系、艺术系、通用航空系、机电工程系、化工工程系等6个教学系部，继续教育部、基础部、体育教学部、培训部、网络信息中心、科研与技术服务处等6个教学辅助部门和党政办公室、组织统战部、人事处、宣传部、纪检处、计划财务处、教务处、后勤保卫处、招生就业处、学生工作处、团委、工会等12个行政部门。

学院结合地方经济社会发展需要，合理调整专业布局，基本形成二产类专业集中在乌斯太校区办学，三产类专业、成人学历继续教育集中在巴彦浩特校区办学的格局。结合全盟经济社会发展，学院明确提出振兴化工机电专业发展思路，确定将应用化工技术专业打造成位列全区高职院校前列的工作目标，将乌斯太校区打造成集学历教育、技能培训、创新创业、科研和社会服务为一体、主攻服务千亿元园区建设的综合性职业教育示范基地。目前开设高职专业33个、中职专业41个。

医疗护理系：前身为阿拉善盟卫生学校，有40多年办学历史，建有实验实训室和综合教室21个，临床实习基地14个，现有护理学、康复治理与技术、口腔医学技术3个专业。

经济管理系：设立时间最久、品牌影响最广、师资力量最为雄厚的系部之一，多次斩获全国、自治区及行业中高职技能大赛大奖，现有大数据与会计、计算机应用技术、旅游服务与管理3个专业。

艺术系：重点建设系部，已建成盟级职工创新工作室2个，名师带徒工作室3个，全国民族舞蹈培训基地1个，手工地毯织造工作室1个，现有民族表演艺术、学前教育、雕刻艺术、工艺美术4个专业。

通用航空系：2019年成立，现有航空电子电气技术、无人机技术应用、航空服务、民航安全技术管理、机场运行服务与管理5个中高职专业。

机电工程系：重点建设系部，经过多年发展已成为培养我盟和周边地区煤化工、盐化工、精细化工生产企业、制造业生产一线中高级技术应用人才重要基地，现有风力发电工程技术、机电一体化技术、电力系统自动化技术、汽车检测与维修技术、汽车电子技术5个专业。

化工工程系：重点建设系部，近年来相继完成国家、自治区多项科研项目，获得多项国家实用新型发明专利，现有应用化工技术、分析检验技术、化工装备技术、精细化工技术4个专业。

现有在编在岗教职工394人，中共党员185人（占47%），教职工中受聘党政管理人员68人，专业技术人员294人、工勤人员32人；高级职称104人（占26.3%），中级职称119人（占30%），初级职称71人（占18%）；博士3人，硕士学位62人（占15.7%），本科学历332人（占84%）。

近年来，学院组织师生参加各级各类技能大赛荣获盟级以上奖项125项，其中盟级20项；自治区级74项；国家级（行业协会）31项。

现有在籍学生8473人，其中全日制在校生5088人 （高职3371人、中职1074人、技校643人），主要分布全国18个省份，内蒙古12个盟市；开放大学教育3385人。