学校现代管安徽省医学科学研究院，设有基础医学院、公共基础学院、马克思主义学院、护理学院、口腔医学院、临床医学院（全科医学院）、医学技术学院、公共卫生与健康管理学院、药学院、第一临床学院、国际教育学院、继续教育学院等12个学院，以及安徽省全科医学培训中心、安徽省卫生职工培训中心、安徽省遗传医学中心等多个教育培训与科研机构。设有全科医学教育、口腔技术与材料、感染免疫、护理健康促进、智慧健康养老、生物技术药物、肿瘤分子生物、思政教育、医学文化传承等九个研究所。

学校建有国家职业教育示范性虚拟仿真实训基地培育项目-智慧医学虚拟仿真实训中心1个、国家级校企共建生产性实训基地2个、中央财政支持建设实训基地2个、省级示范实训中心7个，省级创新创业学院1个。设有临床技能实训中心、护理实训中心、检验实验中心、药学综合实验实训中心、养老服务综合实训中心、公共基础实验实训中心、形态学实验中心、机能学实验中心等校内实验实训中心/基地17个，校外实践教学基地229个。

学校设有全科医学教育、口腔技术与材料、感染免疫、护理健康促进、智慧健康养老、生物技术药物、肿瘤分子生物、思政教育、医学文化传承等九个研究所。设置“医、药、护、技、管”五大类招生专业18个，有中国特色高水平专业群1个，国家级骨干专业4个，省级特色（重点）专业13个。

学校师资队伍力量雄厚。现有专任教师总数796人，校内专任教师中具有硕士及以上学位的教师占比近70%；副高及以上专业技术职务教师325人；正高级专业技术职务81人（其中教授40人）；“双师型”教师占比60%以上。有国家“万人计划”教学名师1人、全国辅导员年度人物提名1人、省级教学名师21人、省级教学团队30个、省级专业带头人11人、省级教坛新秀31人；有国家级职业教育教师教学创新团队1个、省第十四批“115”产业创新团队2个。

安徽医学高等专科学校是安徽省卫生健康委直属的公办普通专科学校，创办于1955年，现有芜湖路、芙蓉路、新桥三个校区，全日制在校生12000余人、本科生（联合培养）240余人。