动植物检疫专业始建于于2004年，2005年开始招生，“双万计划”省级一流本科专业。本专业立足国家对外贸易、生物安全、生态屏障建设和区域特色农业发展的重大需求，依托植物保护学院植物病理学、昆虫学、农药学、入侵生物学等优势学科及农业生物多样性应用技术国家工程研究中心、云南省农业生物多样性利用与保护重点实验室（省部共建国家重点实验室培育基地）、农业生物多样性与病害控制教育部重点实验室、云南省植物病理重点实验室、云南省生物多样性与生物技术创新人才培养基地等一批国家级、省部级科研与实践教学平台，建成了涵盖本科、硕士、博士教育特色鲜明的人才培养体系。

本专业秉承以学生为中心，人才产出为导向理念，积极探索契合西南边疆动植物检疫高素质人才需求的新农科OBE人才培养模式。以科研促教学，加强“入侵生物学”与“植物检疫学”相关学科建设，使科研水平和教学质量不断提高。与国内外知名研究机构、高校在人才培养、科研协作、团队建设建立了长期的合作关系，在有害生物风险分析、外来有害生物监测与预警、生物多样性保护与利用、有害生物防控与综合利用等领域取得了显著成果，对保障国家生物安全、生态安全和促进中国-东盟自由贸易区的建设作出了积极贡献。

本专业修业年限四年，授予农学学士学位。