学校设有农业与生物技术学院、园林与水利工程学院、动物科学学院、数字经济学院、数智技术学院、智慧农业工程学院等6个二级学院。

聚焦技术革新，开展立地式研发。历史上科研工作获得国务院嘉奖。坚持应用型科研发展方向，聚焦农业产业新技术研发、转化，引领农业技术革新，着力解决农业产业和地方经济社会发展难题，着力打造区域农业科技创新和成果转化新高地。加强科研平台建设，围绕种子种苗、碳汇康养、畜牧兽医、农业经济、智慧农业等八个研究领域，建有国家级农业科技园区、浙江省浙南作物育种重点实验室、省级协同创新中心等国家级和省市级科研平台32个，建有实体研究所17个。近五年立项市厅级以上项目443项，其中，国家级项目4项、省部级项目42项；外来到位科研经费1.2亿元；获得市厅级以上奖项45项，其中，省部级奖项5项；通过国家审定、登记的农业新品种16个，省级审定、认定的农业新品种7个，授权发明专利114项，科研工作总体水平处于全省高职院校前列。

浙江省高水平专业群2个：绿色食品生产技术专业群、畜牧兽医专业群

教育部骨干专业2个：动物医学、计算机网络技术

中央财政支持专业2个：计算机网络技术、园艺技术

温州市级特色优势专业群3个：园艺技术专业群、人工智能技术服务专业群、数字国贸专业群

浙江省优势专业4个：动物医学、计算机网络技术、园林技术、设施农业与装备

浙江省特色专业5个：畜牧兽医、绿色食品生产技术、国际商务、设施农业与装备、园林技术

按国家招生管理规定录取并取得我校正式学籍的学生，在规定年限内达到所在专业毕业要求者，颁发温州科技职业学院印鉴的全国普通高等教育专科（高职）毕业证书。

在编教职工700多人，柔性引进中国工程院院士等高层次人才31人，其中高级职称190人，博士54人、硕士520人，博士、硕士在专任教师中占比位居全省高职院校前列；省“151”人才、省突出贡献中青年专家、浙江工匠、市专业技术拔尖人才、市优秀青年拔尖人才、市“551”人才第一第二层次人员、市特支计划人才等高层次专业人才总量位居全省高职院校前列。

在校生1.26万余人