制药工程专业于2004年设置，2005年开始招收全日制本科生，截至目前，已连续培养15届毕业生。2013年成为兰州理工大学18个重点建设专业之一，专业2023年通过中国工程教育专业认证，认证后的专业教育教学质量标准可实现国际实质等效，毕业生获得全球流动“通行证”。专业现有专任教师16人，其中教授5人，副教授8人，讲师3人，博士学历教师16人，硕士研究生导师14任，博士研究生导师2人，7人具有海外留学经历，从省内外著名制药企业和药品质量监管部门聘请兼职导师20余人。专业秉承“学生中心、产出导向、持续改进”的工程教育理念，毕业生研究生录取率始终稳定在30%以上，多数学生在北京协和医学院、南开大学、华东理工大学、西北工业大学、大连理工大学、兰州大学、中国科学院大学等双一流高校深造，绝大多数毕业生在东南沿海地区的医药制造行业就职。

本专业培养适应社会经济发展和制药行业需求，具有运用化学、药学和化学工程与技术等学科相关理论知识与专业技能，在制药及相关领域从事工程设计、生产运行、项目管理和产品研发等方面的工作，能够解决药品生产与研发相关复杂工程问题，具有远大理想、家国情怀、创新精神和国际视野，德智体美劳全面发展的高级专门人才。

本专业为全日制四年学制，授予工学学士学位；在药学、生物与医药、生物工程具有硕士学位授予权。

主要课程：有机化学、无机及分析化学、物理化学、化工原理、工程制图基础及CAD、制药工程导论、生物化学、微生物学、天然产物化学、药物化学、药物分析、药物合成反应、工业药剂学、药理学、制药工艺学、制药分离工程、制药设备与车间设计、制药工程安全与环保、药品生产质量管理工程、技术经济与项目管理等。

主要实践性教学环节：金工实习、化工原理课程设计、化工原理实验、有机化学实验、无机及分析化学实验、大学物理实验、物理化学实验、生物化学实验、微生物学实验、制药工程专业基础实验、制药工程专业综合实验、制药工程课程设计、科研创新训练、认识实习、生产实习、科研创新训练和毕业设计(论文)等。