学校学年制学费标准为:文科类专业4660元/学年，理工科类专业4940元/学年或5220元/学年；艺术类专业9600元/学年，体育类专业5220元/学年；软件工程专业1、2年级10000元/学年，3、4年级9000元/学年；中外合作办学专业14000元/学年，中外合作办学专业2025年收费标准若有变化（其中电子信息工程（中外合作办学）专业调整为25000元/学年），最终以物价主管部门审批的收费标准为准。学校普通本科专业自2024级起实行学分制收费 (中外合作专业仍按学年制收费)。学分制收费由专业学费和学分学费两部分组成。其中，专业学费按学年收取，学分学费按照“先选课后缴费”的原则根据学年中学生实际选定课程规定的学分计收。学校学生按学分制培养方案正常完成学业所缴纳的学费总额原则上不高于实行学年制的学费总额，具体收费标准以南昌航空大学计划财务处网站公布的为准。各专业住宿费标准为1000元/学年。